Development of a novel chemokine signaling-based multigene signature to predict prognosis and therapeutic response in colorectal cancer

概要目的开发一种基于趋化因子信号通路的多基因模型, 可以有效预测结直肠癌患者的总生存期和治疗反应.创新点结直肠癌具有高度异质性, 迫切需要开发可靠的标志物用于预测患者的预后和治疗效果. 研究显示趋化因子信号通路关键基因表达变化与结直肠癌转移和预后密切相关, 但尚缺乏基于该信号通路的基因模型用来预测患者的临床预后 . 本研究基于趋化因子信号通路构建了一种新的多基因模型 (CSbMgSig), 用于结直肠癌患者的预后风险分层和总体生存时间预测, 为结直肠癌患者的治疗提供指导.方法首先, 考虑到转移对结直肠癌预后的重要影响, 我们在原发和转移性结直肠癌样本中鉴定了差异表达的趋化因子信号通路相关基因. 然后, 结合单因素 Cox 回归分析和 LASSO Cox 回归分析建立基于趋化因子信号通路的预后模型 CSbMgSig, 并 在另一个独立数据集通过 Kaplan-Meier 生存分析和时间依赖性受试者工作特征 (ROC) 分析进一步验证其预后性能. 此外, 我们还进行了基因本体 (GO) 富集分析、 基因集富集分析 (GSEA)、 单样本基因集富集分析 (ssGSEA) 和化疗反应分析, 以 探索 CSbMgSig 在结直肠癌致病机制中的功能及其对免疫浸润和化疗反应的影响.结论构建的由 8 个趋化因子信号通路相关基因组成的预后模型 CSbMgSig, 可以有效地在训练集和验证...
Source: Journal of Zhejiang University. Science. B. - Category: Universities & Medical Training Source Type: research